Zaman içerisinde tıkanan, istenen debi ve kalitede su üretemeyen membranlar ve modüller özel prosedürlerle yıkanarak eski formlarına kavuşabilmektedir. Membran yüzeyine zarar vermeyen özel kimyasallarla farklı sıcaklık derecelerinde yıkama işlemi yapılmaktadır.